小头畸形与正常比例图

寨卡病毒与登革热，黄热病，日本脑炎和西尼罗河病毒有亲属关系。它会引发类似温和的形式的登革热的症状，由休息与症状治疗，目前还无法通过药物或疫苗来预防。寨卡病毒经由母亲传染给孩子，新生婴儿感染此病毒可能导致小头畸形，而成人感染可能影响神经系统，包括格林－巴利综合征亦可能有所关联。

在2016年1月，美国疾病控制与预防中心（CDC）发布了受影响的国家名单，包括强化注意事项，建议孕妇考虑推迟旅行的旅行指南。其他国家的政府或健康部门也很快发出类似的旅行警告，而哥伦比亚，多米尼加共和国，厄瓜多尔，萨尔瓦多，牙买加建议女性推迟怀孕，直到更多的人知道其中的风险。

寨卡病毒有包膜呈二十面体，就像是与它有亲属关系的其他病毒，并且具有不分段，单股正链RNA基因组。这是与斯庞德温尼病毒(Spondweni virus)密切相关的病毒，是斯庞德温尼病毒病毒进化枝两种病毒之一。

该病毒最早在1947年4月由黄热病研究所的科学家从被放置在一个笼子中的猕猴分离出，地点在乌干达，维多利亚湖附近的寨卡森林[3]。随后在1948年1月在同一地点，从非州斑蚊第二次被分离出来。在1952年当猴子出现发热症状，研究人员从它的血清中分离出传播病原体，这是第一次描述为寨卡病毒。在1968年它首次从尼日利亚人分离出来。从1951年到1981年人类感染的证据是从其他非洲国家如中非共和国，埃及，加蓬，塞拉利昂，坦桑尼亚和乌干达，以及在亚洲的部分地区，包括印度，印度尼西亚，马来西亚，菲律宾，泰国和越南都有报导。

寨卡病毒有非洲裔和亚洲裔两个谱系。演化学研究显示，在美洲蔓延的病毒与法属波利尼西亚的菌株密切相关。寨卡病毒的完整基因组序列已经公布。从最近序列调查初步结果，在公共领域发现了一个在非结构蛋白1密码子可能的变化，这可能会增加在人体中病毒复制的速度。